Kritická digitální infrastruktura, která je základem globálního biomedicínského výzkumu, FlyBase, čelí existenční hrozbě kvůli nedávným škrtům ve federálním financování. Tato krize, pramenící z rozhodnutí Trumpovy administrativy zrušit klíčový grant Harvardově univerzitě, zdůrazňuje nejistou povahu veřejného financování vědy a její hluboké dominové efekty na objevování léků, porozumění nemocem a širší vědeckou ekonomiku. Potenciální ztráta této životně důležité databáze ohrožuje desetiletí vědeckého pokroku a efektivitu budoucího výzkumu po celém světě.
Po více než století byla běžná ovocná muška (Drosophila melanogaster) nepostradatelným modelovým organismem, který sehrál klíčovou roli v základních vědeckých objevech, od pochopení genetických mutací způsobených rentgenovými paprsky až po identifikaci genů kritických pro naše vnitřní biologické hodiny. FlyBase slouží jako centrální úložiště těchto objevů, spravuje a shrnuje téměř 90 000 studií. Tento online zdroj je nezbytný pro výzkumníky k navrhování nových experimentů, urychlení zkoumání příčin nemocí a vývoji nových léčebných postupů, přičemž měsíčně zaznamenává přibližně 770 000 zobrazení stránek od vědců z celého světa. Jeho aplikace zahrnují personalizované terapie vzácných raakovin, modelování lidských neurodegenerativních onemocnění a screening kandidátů na léky pro stavy, jako je Alzheimerova choroba.
Bezprostředním katalyzátorem nejistého stavu FlyBase je zrušení federálního grantu Harvardově univerzitě Trumpovou administrativou, což je součást širších úprav financování ovlivňujících tuto instituci. Harvard dostával přibližně 2 miliony dolarů ročně z federálních fondů na údržbu FlyBase, což tvořilo drtivou většinu jeho provozního rozpočtu. Náhlé stažení těchto finančních prostředků vedlo k propouštění, což ohrožuje budoucnost databáze a její schopnost usnadnit efektivní výzkum.
Důsledky přesahují Harvard a ovlivňují partnerské instituce a mezinárodní biomedicínskou výzkumnou komunitu. Univerzity jako New Mexico, Indiana a Cambridge v Anglii, které spolupracují na správě FlyBase, jsou rovněž zasaženy. Zatímco Indiana a Cambridge se podařilo zajistit prozatímní finanční prostředky pro své části programu, pozice na Harvardu a v New Mexico již čelily nebo jsou naplánovány k propouštění. Tato provázanost podtrhuje, jak škrty ve financování jediného projektu mohou vyvolat kaskádu narušení globálně, což ovlivní více než 4 000 laboratoří závislých na FlyBase.
Přestože Fakulta umění a věd Harvardu poskytla prozatímní financování, tato podpora má skončit v říjnu. Situaci dále komplikuje skutečnost, že soudní příkaz k obnovení grantů pro harvardské výzkumníky postižené škrty dosud nevedl k přísunu finančních prostředků do FlyBase, a administrativa naznačila záměr se proti rozhodnutí odvolat, což vytváří přetrvávající nejistotu. Americké ministerstvo zdravotnictví a sociálních služeb, které dohlíží na Národní instituty zdraví (NIH), se k záležitosti odmítlo vyjádřit, zatímco Bílý dům nereagoval na žádosti o komentář.
FlyBase, v provozu od roku 1992 a po více než tři desetiletí podporovaná federálními fondy, nepřetržitě spravuje výzkumné práce, organizuje genetické nálezy a katalogizuje informace o geneticky modifikovaných ovocných muškách. Tento hmyz je klíčovým modelem, protože jeho genomy a mozky jsou dobře zmapovány a je nákladově efektivní a snadno se s ním manipuluje v laboratorních podmínkách. Vědci jako Celeste Berg, profesorka genomických věd na Washingtonské univerzitě, se denně spoléhají na FlyBase při identifikaci genů zájmu pro experimenty, přičemž poznamenává, že „to, co víme o lidských genech a jejich fungování, pochází téměř výhradně z modelových systémů, jako je drosophila“, vzhledem k tomu, že lidé sdílejí přibližně 60 % svých genů s ovocnými muškami. Síť pro nediagnostikované nemoci (Undiagnosed Diseases Network) také používá FlyBase k porovnávání genetických mutací u dětí se vzácnými onemocněními s ověřeným výzkumem u much, což pomáhá diagnostickým snahám.
Toto narušení financování ohrožuje také významnou iniciativu NIH: Alianci genomických zdrojů (Alliance of Genome Resources). Od roku 2017 NIH ročně vyčlenila přibližně 5 milionů dolarů na sloučení několika databází modelových organismů, včetně FlyBase, WormBase a Mouse Genome Database, s cílem vytvořit „komplexní“ zdroj pro výzkumníky v oblasti lidského zdraví. Paul Sternberg, profesor biologie na Kalifornském technologickém institutu, který vede úsilí Aliance, zdůraznil význam této konsolidace pro efektivní výzkum. Rozpočet Aliance však vypršel 30. června a krize ve FlyBase představuje neočekávanou překážku této širší integrace, což potenciálně zpozdí kritické pokroky.
V současné době se FlyBase snaží získat podporu prostřednictvím crowdfundingu, aby překlenula finanční mezeru a urychlila svou integraci do Aliance genomických zdrojů, než se její operační kapacita zhroutí. Podle Briana Calviho, člena manažerského týmu FlyBase na Indiana University, iniciativa získala méně než 100 000 dolarů oproti odhadované potřebě 1 milionu dolarů. Potenciální ztráta klíčového personálu kvůli propouštění by mohla způsobit, že databáze bude neobnovitelná, což by znamenalo „bod, odkud není návratu“ pro toto nepostradatelné vědecké aktivum. Představitelé Harvardu uznávají důležitost databáze a aktivně hledají další financování, ale bezprostřední budoucnost FlyBase a její hluboký dopad na globální biomedicínský výzkum zůstávají kriticky nejisté.